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腦損傷可以引起驚厥，驚厥發作也可造成腦損傷。有人證明，一次驚厥發作對近記憶力有一過性影響，相當于腦震蕩所致損害；驚厥持續狀態可產生嚴重腦損害，而致智力低下。因為在驚厥性放電時，腦組織有大量的神經元發生快速、反復的脂除極化，需較多的能量維持鈉鉀泵的功能，神經遞質的合成與釋放也增加，細胞代謝過程加快，而且驚厥時體溫升高，肌肉抽搐也使全身代謝增加，高熱可使動物腦代謝增加25%，這些活動所需能量比正常高出2-4倍。腦的異常放電活動即驚厥放電本身對能量的需要也明顯增加，這也是引起腦損傷的一個重要原因。所以驚厥給腦造成了最大的代謝負擔。

熱性驚厥為小兒驚厥中最常見的一種，預后一般良好，引起智力低下的發生率很低，這是因為一般單純性熱性驚厥，發作次數少、時間短、恢復快、無異常神經征，因此驚厥發作時對大腦的影響較少。但是其中有少數患者可以引起智力低下，目前對此有兩種解釋，一種認為嚴重的熱性驚厥可以引起腦損傷，以致出現癲癇及智力低下，這是指驚厥持續時間越長，驚厥復發次數越多，出現腦損傷的可能性就越大。另一種觀點認為，在熱性驚厥前，神經系統已出現異常，這種小兒即使不發生熱性驚厥也會出現智力低下，即認為熱性驚厥病兒的神經系統癥狀并非驚厥本身所致，而是存在于熱性驚厥起病之前，熱性驚厥與智力低下并非因果關系，而是共同原因所決定的。

另外驚厥引起腦損傷和年齡也有密切關系。小兒驚厥持續30分鐘以上就可以產生神經元缺血性改變，而成人驚厥超過6小時才發生這種改變。這是因為嬰幼兒時期腦組織代謝活躍，神經細胞處于生長、分化旺盛時期，正在發育的腦組織最易受損害，所以驚厥發病年齡越早，其智力低下的發生率可能會越高。

總之熱性驚厥之前如已有神經系統異常，可能導致將來的智力低下，嚴重驚厥本身也能引起腦損傷而影響智力。