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無論用哪種方法計算所得的小兒用藥劑量都有一定的局限性，一般均未涉及生理和病理因素對藥物體內過程的影響。而在實際應用時，必須結合患兒當時的具體情況及用藥目的作適當調整。用藥時應考慮到下列因素：
  
1、腎功能受損：腎臟是排泄藥物及其代謝產物的重要器官，并在維持機體內環境穩定上起重要作用。腎臟疾病對藥物的吸收、分布均有影響，尤其對藥物的排泄影響較大。腎臟疾病時排泄減慢，使得一些藥物及其代謝產物在體內蓄積，引起中毒。因此對一些主要從腎臟排出的藥物如慶大霉素、卡那霉素、地高辛等使用時應減少劑量。特別是腎功能衰竭時應嚴格按照用藥時腎功能的狀況計算藥物的劑量。
  
2、肝功能受損：肝臟在機體的新陳代謝中起重要作用。肝臟疾病對藥物的影響主要表現在對藥物的分布及代謝上。肝臟疾病患兒服用主要經肝臟代謝及排泄的藥物時需減少劑量，如紅霉素、氯霉素等。
  
3、病情及病種不同：一般來說對重癥患兒，用藥量需要加大。如青霉素治療一般感染每天每千克體重3-5萬單位即可；而在治療化膿性腦膜炎時劑量可以大幾倍甚至十幾倍。
  
4、用藥目的不同：同一種藥因用藥目的不同而劑量不同。如苯巴比妥用于抗驚厥時劑量要大，而用于鎮靜時劑量較小。
  
5、用藥途徑不同：同一種藥物，如果用藥途徑不同，用藥劑量差異很大。如靜脈注射給藥量比口服量要小。具體使用時應加以注意。
  
對于一些需要長期服用的藥物，如癲癇患兒服用的苯巴比妥、卡馬西平、丙戊酸鈉等，應根據血液中藥物的濃度即血藥濃度及臨床表現不斷調整藥物劑量，高血壓患兒也應根據血壓調整降壓藥的用量。